近年来，科学家研究发现，小分子肽作为蛋白质的功能活性片段，不仅比蛋白质的营养价值高，能提供人体生长、发育所需要的营养物质，而且具有许多蛋白质所不具备的独特的生理活性。
1、小分子肽易吸收、无抗原性。
蛋白质是具有高度种属特异性的大分子，不易吸收，必须经过消化过程分解为氨基酸或小肽才能吸收。目前的研究认为，小肽能以完整形式被吸收进入循环系统时，没有任何废物及代谢物，能被人体全部利用。此外，蛋白质的分子量很大，一般在一万以上，分子量越大，表面的抗原决定簇就越多，化学结构也较稳定，不易被机体破坏或排除，在体内停留时间也较长，有充分的机会与产生抗体的细胞接触，刺激机体产生免疫反应。而小分子肽具有低抗原性或无抗原性。
2、小分子肽生物活性极强，作用范围广。
小分子肽的生物活性高，在极其微量的情况下，也能发挥其独特的生理作用。小分子生物活性肽具有传递生理信息、调节生理功能的作用，维持着人体正常的生理活动。从细胞到组织器官，都可以发现小分子生物活性肽的作用。
3、小分子肽结构易于修饰和重新合成。
由于小分子肽的结构相对于蛋白质而言要简单得多，因此小分子活性肽结构易于改造修饰，人工合成成本较低，这些特点为多肽药物的开发提供了广阔的前景。
4、小分子肽不会引起营养过剩。
从营养上讲，小分子肽的营养优于蛋白质，蛋白质只有分解成小肽才能被吸收。过量摄入蛋白质会有一定副作用，因为蛋白质在人体内的分解产物较多，其中氨、酮酸及尿素等对人体会产生副作用，不仅增加肝脏负担，还容易引起消化不良，影响肾脏功能。美国科学家发布一项声明指出，食用过量的蛋白质会增加患癌症的风险，如直肠癌、胰腺癌、肾癌及乳腺癌。食用动物性蛋白质如蛋类、奶类及肉类过多，还可以诱发心脏病。痛风、肝肾功能衰竭的病人，更要限制蛋白质的摄入。而小分子肽摄入后不但不会引起营养过剩，而且还可以调节人体的营养平衡。
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